在食物鏈底層的微藻具有CO2利用效率佳、生產力比陸生植物高、可利用貧瘠土地培養等優點，過去曾因可作為生質燃油原料而成為全球注目的焦點。近年，微藻應用重心轉至作為食物、飼料、材料及化學品之料源。海洋微藻含有高量油脂、蛋白質與碳水化合物，可應用於不同的市場，特別是含有豐富二十碳五烯酸 (Eicosapentaenoic acid, EPA) 與二十二碳六烯酸 (Docosahexanenoic acid, DHA) 等長鏈多元不飽和脂肪酸 (polyunsaturated fatty acid, LCPUFA) 的微藻 (如等鞭金藻與擬球藻)，可開發直接作為食物或取代魚油做為動物飼料，是歐盟25研究夥伴未來5年的研發重點。