「養魚先養水」集約式的水產養殖過程中，管理者為減少養殖魚蝦排泄物或殘餌所產生的有機物累積，都在放養前進行〝養水〞的作業，使池中藻菌達到平衡以轉化這些養殖代謝物，達到池塘管理的目的，但仍需要換水來降低養殖池中的有機負荷。反觀養殖水耕系統，則可經由縝密的規劃，藉助水耕植物來淨化水質，這樣的系統不僅節省用水，同時可以有效的循環利用系統所產生氮與磷等化合物；所以，水產養殖動物的角色不再是消極的有機廢物製造者，反變成植栽作物的養分供應者。