科學魚探的主要功能在勘查水面下海洋生物的體型大小與生物量分布情形。經由分析所記錄之標物反射強度 (Target Strength, TS)，可推估海洋生物體長組成分布，而由體積散亂反射強度 (Volume backscattering strength, SV) 可瞭解海洋生物分布水層及密度。目前單頻及多頻科學魚探普遍用於海洋生物日週垂直洄游及生物量估計研究，尤其適用於具有明顯群集特性或具優勢種而低生物多樣性的海域。浮游動物資源量的變動對於魚類資源具有直接或間接影響，因此在漁場形成機制中，浮游動物具有相當的重要性。然台灣位處亞熱帶，海洋生物相具有高多樣性，由於不同生物所產生的頻率反射特性不同，僅以科學魚探進行浮游動物及魚類資源量的探勘確是有其困難，為此本研究透過聲波遙測及現場實地浮游生物採集，調查台灣周邊海域浮游動物現存量之時空間變動情形，作為漁場變動監控之參考指標。