台灣的養鰻業，近年來因鰻苗來源的變動、水資源之受限以及來自中國、馬來西亞等鄰近國家的競爭，遭受相當大的衝擊，其中，又以鰻苗捕獲尾數的豐歉變動之影響最為嚴重。由於養鰻業係屬高附加價值的產業，為台灣重要之出口水產物。為此項產業的振興，增加鰻苗資源，實為刻不容緩的首要課題。有鑑及此，本所為增加鰻線資源，乃自1976年起陸續實施種鰻放流，迄已達19次，共放流種鰻24公噸(約4萬餘尾)，此項積極增加鰻苗之措施，普獲國內、外養鰻界之重視與肯定。