民國60年 4月20日奉准成立台灣省水產試驗所馬公工作站，暫借 澎湖區漁會二樓辦公，以澎湖近海漁海況及珊瑚漁業調查為主要工作 ，62年升格為澎湖分所。63年於白沙鄉岐頭村興建研究大樓及養殖池 後，全體員工集中至白沙。65年為改善澎湖地區之水產加工事業，奉 准撥用澎湖水產學校實習工廠，經整修後將漁業、加工及行政等業務 人員遷回馬公，以做為分所之行政中心，而白沙則專責繁養殖試驗業 務。72年又因業務需要，在西嶼鄉大果葉村興建辦公室一棟，負責辦 理海洋牧場示範區之業務。73年為因應栽培漁業之未來發展，於馬公 增加資源保育之業務，78年並奉准建造30噸級近沿海試驗船乙艘，全 面推動澎湖水產事業之發展。