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文蛤是在臺灣市場常見的二枚貝，不論是在傳統市場、超市或大賣場都可以看到，因為文蛤的生理特性，可使用真空包裝的方式進行運輸，更是少數在電商通路上方便購買到鮮活的水產品。

在臺灣，文蛤的人工養殖可追溯到1920年代，從粗放式的淺海養殖演進到集約式的魚塭養殖，已經超過了百年歷史，2022年的產量規模已經達到5.41萬公噸。然而，近年來極端氣候的影響之下，養殖文蛤也傳出受災，不免讓人擔心是否隨著長時間的人工繁殖而造成過度的近親繁殖，引發近交衰退 (inbreeding depression) 導致文蛤連續性死亡、族群數量的銳減，危害到產業的發展。

在討論近交衰退前，首先來瞭解比較容易理解的近交 (inbreeding)，近交就是近親交配或近親繁殖，指的是親緣關係相近的個體間的交配，在人為育種之下，近交是很常使用的方法，可以快速固定想要的性狀，然而，連續的近交會導致基因多樣性降低，若是沒有良好的管理及策略，很可能就會引起近交衰退，衰退的面向可能很多，最令人擔心的就是造成對環境適應能力下降、生物的活存率和繁殖力下降，導致族群數量的銳減。

在2001年代的九孔曾經遇過這樣的危機，2002年後，陸續發生九孔幼苗大量落板死亡現象及養殖九孔大量死亡情形，根據持續的現場調查發現，九孔幼苗因畸形率高而導致高的死亡率，另九孔性腺過早成熟，遇水溫劇變刺激即大量排精排卵，導致身體虛弱而死亡，幼苗畸形率高及早熟現象是過度近親繁殖的徵兆。進一步分析發現，養殖九孔族群的遺傳變異及基因歧異度遠低於野生九孔族群，而幼苗落板大量死亡與基因歧異度低有極顯著關係。九孔的繁殖策略是一公多母 (常使用的雌雄比為20:1)，在連續的自繁自養之下，導致九孔的遺傳多樣性降低，降低了對環境的適應能力，引發了近交衰退，在環境和疾病的因素衝擊下，整個族群就受到嚴重的影響，當發現原因後，後續產官學各界透過系統雜交方法育成幼苗，現今已逐步改善並穩定九孔養殖的狀況。