| 水產生物學名 | Apogonidae | 天竺鯛科 |
| 水產生物學名 | Apolemichthys trimaculatus (Cuvier & Valenciennes) | 三斑棘蝶魚 |
| 水產生物學名 | Aporps bilinearis Schultz | 雙線准雉鱸 |
| 水產生物學名 | Aprion kanekonis Tanaka | 田中笛鯛 |
| 水產生物學名 | Aprion virescens (Cuvier & Valenciennes) | 藍笛鯛 |
| 水產生物學名 | Apristurus macrorhunchus Tanaka | 廣吻篦鮫 |
| 水產生物學名 | Arachnoides placenta | 海錢 |
| 水產生物學名 | Arca (Anadara) granosa | 泥蚶 |
| 水產生物學名 | Arca inflata | 魁蚶 |
| 水產生物學名 | Arca subcrenata | 毛蚶 |
| 水產生物學名 | Archamia biguttata (Lachner) | 雙斑長鰭天竺鯛 |
| 水產生物學名 | Archamia dispilus (Lachner) | 橫紋長天竺鯛 |
| 水產生物學名 | Archamia fucata (Cantor) | 褐斑長鰭天竺鯛 |
| 水產生物學名 | Archamia lineolata (Cuvier & Valenciennes) | 原長鰭天竺鯛 |
| 水產生物學名 | Argentina kagoshimae Jordan & Snyder | 水珍魚 |
| 水產生物學名 | Argentina semifasciata Kishinouye | 半帶水珍魚 |
| 水產生物學名 | Argentinidae | 水珍魚科 |
| 水產生物學名 | Argopecten irradians | 海灣扇貝 |
| 水產生物學名 | Argyropelecus aculeatus Cuvier & Valenciennes | 銀斧狗母 |
| 水產生物學名 | Argyrops bleekeri Oshima | 小長旗鯛 |