| 1998年日本鰻柳葉體之異常漂移 | 廖學耕‧吳繼倫‧黃士宗‧康偉福 | 2000 |
| 九孔之基因轉殖 | 楊鴻禧‧蔡懷禎‧丁雲源 | 2000 |
| 九孔養殖經營現況調查 | 郭仁杰‧劉富光 | 2000 |
| 中層人工浮魚礁之設置及其漁海況變化 | 林俊辰‧吳龍靜‧謝勝雄‧吳春基‧陳淑珍‧陳守仁‧陳秋月‧李政芳‧陳立民‧蘇偉成 | 2000 |
| 日本鰻(Anguilla japonica)人工繁殖試驗 | 賴仲義‧陳冠如‧黃麗玲‧李文有‧陳永欣‧張湧泉 | 2000 |
| 台灣正櫻蝦生物學及其漁場形成機制之研究 | 蘇偉成‧陳守仁‧謝勝雄‧吳春基‧吳龍靜‧陳羿惠‧陳立民‧李政芳 | 2000 |
| 台灣西南海域拖網漁場下雜魚資源調查 | 蘇偉成‧吳春基‧李政芳‧陳立民‧陳秋月‧陳主惠 | 2000 |
| 台灣東部海域菱鰭魷漁場與環境關係之研究 | 陳文義‧吳世宏‧張集昇 | 2000 |
| 台灣海域鯔魚資源調查與監測 | 蘇偉成‧黃朝盛‧吳龍靜‧謝勝雄 | 2000 |
| 地理資訊系統應用於人工魚礁區位選址之研究 | 曾振德、陳世欽 | 2000 |
| 多醣体β-1,3-glucan在生產SPF草蝦苗之應用 | 蘇茂森‧劉冠甫‧洪崑龍‧劉惠敏‧陳紫媖 | 2000 |
| 吳郭魚育種與保種試 | 賴仲義‧蔡添財‧黃世鈴‧陳榮華‧白志年 | 2000 |
| 赤鰭笛鯛種苗生產技術探討 | 朱永桐‧張惠芬‧葉信利‧許晉榮‧丁雲源 | 2000 |
| 抽排文蛤養殖池池底沙層水對文蛤成長之影響 | 陳鴻議‧何雲達‧吳俊榮‧陳蒼木‧王映文‧林秦岑‧劉富光 | 2000 |
| 近紅外光技術應用於魚油品質分析可行性之研究 | 藍惠玲‧王文政‧陳聰松 | 2000 |
| 建立臺灣原生種塘蝨魚種原之微衛星DNA分析技術 | 黃家富‧彭弘光 | 2000 |
| 氨及亞硝酸之急性毒對金目鱸稚魚血液指數之影響 | 許慧文‧黃美瑩‧劉文御 | 2000 |
| 氨及亞硝酸對金目鱸稚魚之急性毒研究 | 黃美瑩‧許慧文‧劉文御 | 2000 |
| 海水魚之病原生物－卵圓鞭毛蟲的生活史與防治研究 | 張正芳‧楊佳宏‧許月娥‧陳紫媖‧蘇茂森 | 2000 |
| 海水箱網養殖魚類生魚片之製作及品質 | 蔡萬生‧陳再發‧薛月娥‧高雪卿‧林慧秋‧洪有隆 | 2000 |