台灣地處熱帶與亞熱帶的交界處，擁有1,140 km的海岸線和80餘個大小的島嶼，在黑潮流、南海水系與中國大陸沿岸水團的交互消長下，蘊育了豐富的生命力，也造成海洋生物歧異度的複雜化。行政院農業委員會水產試驗所自1929年成立後，對台灣周邊海域的生態與水產生物資源的調查不遺餘力，因此也典藏了許多珍貴的水產生物標本，包括哺乳類、爬蟲類、魚類等脊椎動物，及節肢動物、軟體動物與腔腸動物等無脊椎生物。此等標本來源主要為試驗船執行漁業資源調查時網捕之漁獲及外島工作小組的採集，部份來自於漁友的捐贈或海關委託鑑定者或本所養殖的種類，產地包括台灣沿近海域、東沙及南沙島嶼，少數標本為外國種類。其中，軟體動物標本經鑑定計有72科235種，包括腹足綱33科149種、頭足綱22科55種 (包括化石種3科4種)、斧足綱16科30種及掘足綱1科1種。本目錄之貝類學名以于 (2001) 的分類系統排列，並參卓其他學者的意見修正，包括Salvini-Plawen and Steiner, 1996 (腹足類)、Kuroda, 1941、Habe, 1977 (斧足綱及掘足綱)、Sweeney et al., 1998 (頭足綱)。腹足類、斧足綱及掘足綱的中文名稱以巫 (1999) 為主，頭足綱則依據中華民國貝類學會「台灣貝類中文名稱訂名小組」 (1976, 1978)、董 (1988) 及童 (2000) 之命名。目錄名稱前有 * 標示者為化石類群。整理後的實體標本逐一拍照編號，將建立數位典藏資料庫，以供研究、展示及教學之用，使其發揮最大的功能與價值性。