族群遺傳學 (Population genetics) 主要是研究生物族群在演化或人為養殖過程中，遺傳對偶子 (Allele) 之分布及變化情形，進而探討族群間之親緣關係。目前文獻報告上比較廣泛應用的方法是以微衛星DNA基因座 (Microsatellite DNA locus) 作為分子標記，分析、比較所採樣相同族群內或不同族群間微衛星DNA基因座對偶子之分布頻率及遺傳結構等。