建議參考「台灣農家要覽」 漁業篇 (豐年社出版)，或本所網站http://www.tfrin.gov.tw/main_c.html→水產技術→水產養殖手冊。
吳郭魚對疾病抵抗力強，雖然會有寄生蟲寄生，但平常只要注意觀察及管理，不致有大量死亡的問題。吳郭魚出現嚴重的死亡病害為疑似鏈球菌、立克次體或葡萄球菌感染的結果。此病發生在冬天或初春之低水溫期，罹病後以各種藥物藥浴或經口投藥效果都不佳，只有加強防疫隔離措施，非必要人員不要進入養殖場，魚池、池水、網具要以漂白水或石灰確實消毒，病魚也要撒石灰掩埋或焚化處理，清池後徹底挖除堆積於池塘底部的污泥，並使用100 ppm漂白水或每分地60－70 kg生石灰消毒，最好再曝晒3－4週。
其餘之吳郭魚養殖相關問題，請逕行參考上述資料或網站。