一般淡水區域的水生動物，有大肚魚、水蠆 (蜻蜓的幼蟲)、螺類、紅娘華 (又叫「水中蠍子」) 及龍蝨等，在養殖池中都會直接或間接影響蝦類成長及活存，因此在放養蝦苗前應先行整池清除。以柴油消滅水生昆蟲，會直接污染水質及影響水中蝦苗成長及活存。
減少水生昆蟲除使用藥物外，可改變其棲息的生活環境。一般水生昆蟲喜生活在清澈的水域，並繁殖子代，水中透明度較低就不適合其生長，所以提高養蝦池濁度或混養魚類均可防止其增生。
青蛙的幼體蝌蚪，具有尾巴，會在水中游泳，用鰓呼吸；長出2隻腳時係以藻類、浮游生物等為食，若長出4隻腳時則會攝食水中小型生物，包括小蝦苗、水生昆蟲及飼料。