海水中的臭氧無法直接測得，因臭氧在海水中會與海水中的溴離子反應，產生次溴酸鹽及溴酸鹽，在分析時無法分別測出，因此一般是以測定海水中之總殘留氧化物的量代替，分析方法可參考環檢所「海水中總殘餘氧化劑濃度檢測方法－分光光度計法∕碘光度法 (NIEA W453.20B)」。溴酸鹽的測定可參考環檢所「水中陰離子檢測方法－離子層析法 (NIEA W415.52B)」。至於海水中氨氮、亞硝酸鹽氮及硝酸鹽氮亦可依環檢所「水中氨氮檢測方法－靛酚比色法 (NIEA W448.51B) 及水中硝酸鹽氮及亞硝酸鹽氮檢測方法－鎘還原法 (NIEA W452.50C)」方法測得，水中蛋白質一般先測總氮含量後再換算得之，總氮含量測定可依環檢所「水中總氮檢測方法 (NIEA W423.52C)」測得。以上分析方法均可在環檢所 (網址http://www. niea.gov.tw/analysis/epa_www.htm) 查得。其中除溴酸鹽之測定需使用離子層析儀外，其餘均可用分光光度計測得。為了減少海水中鹽類的干擾，可以以蒸餾水稀釋後測定，但需考慮可能增加稀釋的人為誤差影響，例如在測亞硝酸鹽氮時，本來養殖用水中亞硝酸鹽氮濃度就在μg/L (ppb) 的含量，稀釋會增加其人為誤差，影響分析之準確度。又如分析海水中總殘餘氧化劑濃度時，稀釋水中若含氯，也會增加其誤差。因此應先用標準添加法分析，測得其回收率後，確認是否受鹽類干擾，並瞭解其偵測範圍之後才決定是否稀釋。