泰國蝦苗約25天開始變態為後期幼蟲 (正游蝦苗)，此時是泰國蝦苗繁殖的關鍵期，需水質管理、餌料投餵掌控得宜才能過關。育苗過程建議適度流換水並作減菌，尤其在下苗開始第10－14天，育苗池生菌達高峰，懸浮菌相及附著菌相開始消長競爭，容易倒水色，影響蝦苗成長及活存，所以減菌動作是非常重要的一門功課，須拿捏適宜，使兩大菌相和平共存，可使用二氧化氯30 ppm作減菌，使用頻度約3天1次。但由於二氧化氯有效濃度依各廠牌及儲存時間不盡相同，使用濃度請向經銷商問清楚再做拿捏。