有關藻類機能性成分的萃取流程，很難達到『無』重金屬殘留。只能運用不同技術來降低重金屬含量。原料藻的重金屬含量亦是重要的分析點之一，含量過高的藻類，即不建議作為原料使用。然，最重要的是，相關藻類產品均需符合食用藻類衛生標準衛生署食字第0900080664號公告。