臺灣淺堆又稱臺灣淺灘、臺灣灘或南淺，英文為Taiwan bank，位在澎湖海域的西南方。由過去相關研究顯示，該海域是許多重要經濟物種的產卵場，亦是澎湖當地漁民重要的作業海域。然而由於近年來漁業捕撈技術進步，許多高效率與高破壞性之漁具及漁法出現，容易造成區域性漁業資源減少及棲地破壞，產生不可挽救之情境。再加上中國對砂石之需求量高，許多中國鐵殼抽砂船及運搬船常態性進入海峽中線，至臺灣淺堆周邊海域大量進行抽砂及轉載作業，嚴重影響及破壞該海域海洋生態及海底棲地。
浮游動物是海洋生態系中豐度以及多樣性高之一大類群，其水平移動主要都是靠海流之運輸。也因浮游動物即為大部分海洋生物之發育初期，對於適應外在環境變化之能力不足，因此海洋中各區域浮游動物之種類組成與空間分布，與當地海洋環境的變動有著相當密切之關係。而浮游動物對於海域生態極為重要，因體型小可以直接作為許多海洋生物的餌料，也是海洋中無機物轉化成有機蛋白質一連串過程中一個重要環節。此外，浮游動物亦可做為判斷不同流系或水團之依據，即作為指標生物或物種。
魚類的仔稚魚期亦可歸為浮游動物，屬魚類初期生活史，並由其脊索末端之長成及上曲情況，決定其為浮游或具微游泳能力狀態。因為受外在環境變動影響大，故仔稚魚的活存率多寡，對漁業資源的起伏影響甚鉅。透過觀察仔稚魚現存量，可應用於未來進行加入量及資源量推估與預測之重要參數之一。
綜上所述可以發現，若缺少相關基礎資料，對於面臨現今漁業資源過度開發造成魚類資源枯竭之狀況，將缺少可供參考之依據提供給漁政管理單位訂定相關管理政策，以有效預估、管理並降低漁獲量持續下降的情形。據此，本調查透過系統性之監測調查方式收集臺灣淺堆周邊海域浮游動物樣本資料，探討該海域浮游動物之時空變化特性，藉以瞭解臺灣淺堆周邊海域浮游動物之現況，相關成果期能作為有關單位進行政策管理之參考。