黃鰭鮪 (Thunnus albacares) 廣泛分布於全世界的熱帶及亞熱帶海域，棲息水溫約22－28℃，在台灣東北部經東部至西南海域均可捕獲，為台灣產量最多之鮪類。其肉色鮮紅賣相佳，常作為生魚片材料，價格也較黑鮪魚便宜，所以容易被消費者接受，為漁民帶來不少經濟收益。黃鰭鮪容易馴化，本所於2004年在小琉球海域進行箱網養殖試驗，確認黃鰭鮪適合台灣水域養殖，且國外已有在人工水池中自然產卵的紀錄。有鑑於此，本所近年來積極發展黃鰭鮪陸上種魚培育，期望建立人工繁殖技術，為拓展海洋箱網養殖黃鰭鮪產業做準備。本所東港生技研究中心於2005年開始規劃興建陸上大型種魚池，2006年完工並通過驗收後，於2007年5月放養第一批黃鰭鮪，進行種魚培育系統運作測試。爾後持續再放養數批，目前池中有42尾黃鰭鮪種魚，最大體重估計約30 kg，顯示本系統很適合培養黃鰭鮪種魚。