日本地區黑鮪的生殖季節在春季與初夏間，季節短，故有季節性搭配相關育苗措施的問題，且因黑鮪在魚苗階段的高速游泳能力及不能以網子捕撈的特性，培育黑鮪魚苗的設施有別於台灣目前所使用的育苗系統，故必須在相關設備及措施準備完善後，方能進口。此外，黑鮪種魚的培育成本高，日方已投入相當高的經費，在雙方尚無利基的情況下，日方不會輕易出售。