| 日本鰻微衛星DNA基因座之選殖 | 春潭‧賴竹蘭‧陳春暉 | 2001 |
| 水產資訊的整合與應用 | 陳世欽‧張士軒‧林志遠‧謝日豐‧曾振德‧雷淑芬‧李周陵‧陳佳香 | 2001 |
| 以洋流特性探索菱鰭魷漁場 | 廖學耕‧李定安‧吳世宏‧康偉福 | 2001 |
| 台灣西南海域正櫻蝦生態及資源管理之研究 | 蘇偉成‧陳守仁‧謝勝雄‧陳羿惠‧陳立民‧李政芳 | 2001 |
| 台灣西南海域產刺鯧之生殖特性研究 | 蘇偉成‧吳春基‧李政芳‧陳立民‧陳秋月‧陳主惠 | 2001 |
| 台灣沿岸人工魚礁漁場研究 | 王敏昌‧林宏誠‧王瑞霖 | 2001 |
| 台灣沿近海之鎖管種類、特性與分布 | 吳全橙‧林雅民‧陳春暉 | 2001 |
| 台灣海域鯔魚資源調查與監測 | 蘇偉成‧黃朝盛‧吳龍靜‧謝勝雄 | 2001 |
| 台灣現生塘蝨魚種原之專一性隨機擴增片段多形性DNA(RAPD)研究 | 黃家富‧彭弘光 | 2001 |
| 白蝦種蝦生殖力調查研究 | 林明男‧曾寶順‧邱靜山 | 2001 |
| 石斑魚類仔稚苗育成之探討 | 葉信利‧許晉榮‧朱永桐‧丁雲源 | 2001 |
| 利用生物循環淨化草蝦池水之研 | 林世榮‧丁雲源 | 2001 |
| 利用有機活菌液在田間草蝦養殖池之研究 | 郭世榮‧陳敏隆‧丁雲源 | 2001 |
| 性別、日周期及鹽度刺激對黑鯛成魚血液生化因子之影響 | 朱永桐‧葉信利‧許晉榮‧丁雲源 | 2001 |
| 東非海水吳郭魚與尼羅魚雜交子代之成長試驗 | 許慧文‧黃美瑩‧劉文御 | 2001 |
| 沿近海漁場造成之研究 | 林俊辰‧吳龍靜‧吳春基‧陳守仁‧謝勝雄‧陳淑珍‧蘇偉成 | 2001 |
| 花腳蟳之中間育成試驗 | 鄭金華‧吳慧娜‧陳紫媖 | 2001 |
| 建立魚類優良種原及保存體系 | 賴仲義‧蔡添財‧黃世鈴‧陳榮華‧董聰彥‧白志年‧黃麗鈴‧施美娟 | 2001 |
| 庫達海馬繁、養殖技術之研究 | 許鐘鋼˙蘇勰忠˙黃金峰˙歐武雄˙蔡萬生 | 2001 |
| 海水魚類病原生物之生物學與防治研究卵圓鞭毛蟲-II | 張正芳‧楊佳宏‧陳紫媖 | 2001 |