| 水產種苗研究團隊－吳郭魚鑑種、品系保存及選育技術之研發 | 張格銓、張素容、張湧泉、陳榮華、劉富光 | 2012 |
| 水產種苗研究團隊－建立水產養殖之生物防疫生產模式 | 鄭金華、邱家豪、陳昱昕、許月娥、陳紫媖 | 2012 |
| 水產種苗研究團隊－海鱺發光桿菌疫苗抗病效力評估 | 郭錦朱、洪嘉偉、莊雅竹、黃美瑩、周瑞良、李彥宏、陳紫媖 | 2012 |
| 水產種苗研究團隊－神經壞死病毒感染石斑魚細胞株之蛋白質體研究 | 李佳芳、林金榮 | 2012 |
| 水產種苗研究團隊－種魚免疫應用於龍膽石斑優質種苗培育之研究 | 朱永桐、陳陽德、張丁仁、梁貴龍、吳承憬、邱靜山、黃政軒、葉信利 | 2012 |
| 水產種苗研究團隊－龍膽石斑遺傳育種之研究 | 林峰右、吳育甄、胡益順、黃致中 | 2012 |
| 基因轉殖水產生物風險評估技術平台建立(II) | 胡鄴方、朱永桐、吳育甄、林峰右、沈子耘、邱英哲、劉君誠、黃致中、葉信利 | 2012 |
| 水產種苗研究團隊－水產種原分子生物技術輔助育種平台之建立 | 曾福生、商志毅、朱惠真、謝立偉、林金榮 | 2011 |
| 水產種苗研究團隊－海鱺接種含不同佐劑的發光桿菌疫苗之抗體反應 | 郭錦朱、沈昱德、郭誌明、陳紫媖 | 2011 |
| 水產種苗研究團隊－神經壞死病毒感染石斑魚細胞株之蛋白質體研究 | 李佳芳、林金榮 | 2011 |
| 台灣水產重要病原菌及衛生菌快速檢測套組之研發－水產鏈球菌快速檢測套組 | 張錦宜、吳嘉哲、林金榮 | 2011 |
| 基因轉殖水產生物風險評估技術平台建立(Ｉ) | 吳育甄、葉信利、朱永桐、林峰右、沈子耘、邱英哲、劉君誠、黃致中 | 2011 |
| 鱟血液成分應用於內毒素檢測試劑之開發 | 謝明昌、黃丁士、張錦宜、陳其欽、蔡萬生、林金榮 | 2011 |
| 水產種苗研究團隊－水產種原分子生物技術輔助育種平台之建立 | 曾福生、周賢鏘、盧民益、朱惠真、李憶如、林瑩祝、林金榮 | 2010 |
| 水產種苗研究團隊－海鱺發光桿菌疫苗製備法評估 | 郭錦朱、葉宗鑫、郭誌明、陳紫媖 | 2010 |
| 台灣水產重要病原菌及衛生菌快速檢測套組之研發－「水產病原性弧菌檢測套組」 | 張錦宜、吳嘉哲、林金榮 | 2010 |
| 建構水產生物之蛋白質體於水產養殖應用之模型 | 李佳芳、林金榮 | 2010 |
| 精緻農業－建立基因改造水產生物田間試驗設施風險評估技術平台 | 吳育甄、朱永桐、林峰右、沈子耘、劉君誠、邱英哲、黃致中、陳昀佐、葉信利 | 2010 |
| 鱟血液成分應用於內毒素檢測試劑之開發 | 謝明昌、黃丁士、張志堅、陳其欽、蔡萬生、林金榮 | 2010 |
| 水產種苗研究團隊－海鱺發光桿菌疫苗研發 | 郭錦朱、陳智賢、楊舜傑、黃鈺珊、陳紫媖 | 2009 |