| 益生菌之篩選 | 郭錦朱、許月娥、楊佳諺、鄭新鴻、劉冠甫、張錦宜、賴俊吉、陳紫媖 | 2004 |
| 草蝦益生菌生物製劑之研發 | 陳敏隆、吳豐成、林明男 | 2004 |
| 基因轉殖於水產養殖之應用研究 | 楊鴻禧 | 2004 |
| 產氫發酵廢液及其內單離益生菌株之應用研究 | 鄭新鴻、陳凰琴、郭錦朱、許月娥、楊佳諺、賴俊吉、陳紫媖 | 2004 |
| 養殖魚類用疫苗之強化與應用 | 張正芳、楊佳宏、許家惠、陳紫媖 | 2004 |
| 優質九孔種貝之培育 | 陳文義、何源興、陳哲明、江偉全 | 2004 |
| 九孔核醣核酸品質之萃取比較研究 | 楊鴻禧、陳麗靜 | 2003 |
| 以優良基因轉殖於水產生物及其應用研究-抗菌基因在閉式循環水系統中鰻魚的表現及養殖效果 | 曾福生、余俊欣、盧民益、周賢鏘 | 2003 |
| 台灣附近海域野生草蝦族群之遺傳變異度分析 | 鄭金華、曾永瀚、陳紫媖 | 2003 |
| 促進魚類免疫力和抗病力探討-石斑魚益生菌生物製劑之研發 | 丁雲源、吳豐成、陳敏隆、張丁仁 | 2003 |
| 紅色吳郭魚基因遺傳的探討 | 蔡添財、陳榮華、劉富光 | 2003 |
| 國內外主要吳郭魚品系之成長比較研究 | 蔡添財、陳榮華、劉富光 | 2003 |
| 開發何氏棘鲃RAPD核苷酸指紋鑑定技術 | 黃家富、劉富光 | 2003 |
| 種蝦配合飼料的應用效果 | 林明男、曾寶順 | 2003 |