| 深層海水作為肌膚保養品及酒類製品之應用研究 | 吳純衡、吳建威、藍惠玲、陳玉真、徐涵怡、黃培安、高淑雲、郭昭儀、洪郁嵐、陳文君 | 2006 |
| 深層海水作為飲品、天然鹽和肌膚保養品之應用研究 | 吳純衡、藍惠玲、黃培安、賴志行、馮貢國、徐涵怡、高淑雲、郭昭儀、洪郁嵐 | 2006 |
| 單體牡蠣之育肥及貯藏技術研發 | 黃麗月、陳鴻議、葉信利 | 2006 |
| 萃取水產機能性成分作為保健食品和肌膚保養品之研究 | 蔡慧君、胡燕君、杜中菁、吳建威、陳玉真、高淑雲、吳純衡 | 2006 |
| 開發翹嘴紅鮊之RAPD與AFLP核苷酸指紋鑑定技術 | 黃家富、黃德威、劉富光 | 2006 |
| 雄性吳郭魚苗之量產研究 | 陳榮華、張湧泉、劉富光 | 2006 |
| 違禁藥及水產藥物在水產品複合微量殘留篩檢技術之研究 | 郭錦朱、楊佳諺、許月娥、陳紫媖 | 2006 |
| 飼料離胺酸含量與銀鱸成長、肉質及代謝之關係 | 楊順德、林天生、劉富光 | 2006 |
| 臺灣漁業技術知識加值應用與研發 | 陳世欽、徐雅各、謝日豐、陳佳香、李周陵、吳美錚、曾秀茹 | 2006 |
| 澎湖海域生物多樣性基礎研究調查 | 謝恆毅、冼宜樂、陳仁偉、蔡萬生 | 2006 |
| 澎湖海域重要水產生物種原之培育研究 | 黃丁士、許鐘鋼、城振誠、陳東本、陳其欽、涂嘉猷、蔡萬生 | 2006 |
| 澎湖章魚的資源量變化及其生物學之初步研究 | 城振誠、高伸郁、蔡萬生 | 2006 |
| 優質九孔種貝之培育 | 施勝中、何源興、陳文義 | 2006 |
| 優質九孔種貝量產之研發與養殖技術之改進 | 許晉榮、劉君誠、吳承憬、林明男 | 2006 |
| 礁岩性觀賞魚類繁養殖開發 | 何源興、施勝中、陳文義 | 2006 |
| 膽鹼與卵磷脂對海鱺成長與脂質分布之影響 | 何碧月、周瑞良、鄭世榮、陳盈達、陳紫媖 | 2006 |
| 鮪魚冷燻加工之研究 | 彭昌洋、張嘉琦、翁進興、吳龍靜 | 2006 |
| 鮪魚種魚培育技術及生殖習性之研究 | 張賜玲、謝介士、張正芳、鄭明忠、陳紫媖 | 2006 |
| 鮪類幼魚釣獲運輸及箱網養殖技術之研發 | 翁進興、吳龍靜、吳春基、黃建智、陳秋月、陳守仁、張賜玲、周瑞良、何碧月、陳紫媖、冼宜樂、蔡萬生、何源興、陳文義 | 2006 |
| 翹嘴紅鮊之種原保存及育苗研究 | 黃德威、黃家富、劉富光 | 2006 |