| 台灣北部海域中小型拖網單位努力漁獲量之調查研究 | 秦韶生、黃士宗、黃四宇、康偉福、李嘉林、陳慶聲、陳玉姬 | 2005 |
| 台灣西南海域拖網漁業資源監測與管理之研究 | 陳守仁、吳春基、翁進興、陳羿惠、陳秋月、潘惠婉、張麗美、蔡家聖、黃建智、陳明祥、林俊辰 | 2005 |
| 台灣周邊海域漁場環境監測 | 李政芳、王敏昌、陳彥民、黃美瑩、吳龍靜、簡煌彬、楊珮芬、張玉真、陳秋月、林富家、陳慶聲、王友慈、程怡心、劉燈城5、蘇偉成 | 2005 |
| 台灣東北海域浮游橈足類的季節性變動分析 | 李長縈 | 2005 |
| 台灣東北部海域鯖鰺仔稚魚分布之調查研究 | 李嘉林、吳世宏、王友慈、康偉福、曾振德、陳世欽 | 2005 |
| 台灣東部海域鬼頭刀資源之調查與評估 | 陳文義、江偉全、林富家、陳郁凱 | 2005 |
| 台灣東部海域漁場造成之研究 | 吳龍靜、林俊辰、陳守仁、吳春基、翁進興、陳秋月、潘惠婉、張麗美、周慈慧、王敏昌 | 2005 |
| 台灣沿岸海域魚卵及仔稚魚資源調查及評估 | 王友慈、康偉福、簡煌彬、張玉真、黃美瑩、陳秋月 | 2005 |
| 台灣近海鮪類資源調查 | 吳繼倫、李政芳、陳彥民 | 2005 |
| 台灣重要河川魚介類遺傳資源分析與評估 | 黃家富、劉富光 | 2005 |
| 台灣重要經濟蝦類粒線體DNA序列資料庫之建立 | 蕭聖代、賴竹蘭 | 2005 |
| 台灣常見細菌性魚病之PCR快速診斷套組之研發 | 張錦宜 | 2005 |
| 甲殼素及多醣體增進鰻魚免疫能力之研究 | 黃世鈴、楊豐隆、劉富光 | 2005 |
| 石斑魚優質飼料研發 | 吳豐成、陳敏隆、陳麗靜 | 2005 |
| 石斑魚優質飼料研發 | 吳豐成、陳敏隆、陳麗靜 | 2005 |
| 利用衛星海面水溫影像以Canny邊緣偵測法自動測繪海洋鋒面之研究 | 曾振德、黃繼興、劉姵妤、陳世欽 | 2005 |
| 吳郭魚分子育種 | 鄭達智、曾福生、余俊欣、周賢鏘 | 2005 |
| 吳郭魚加工副產物萃取氫氧基磷灰石之研發利用 | 吳純衡、蔡慧君、胡燕君、陳玉真、李沛恒、蕭秀玟、杜中菁 | 2005 |
| 吳郭魚養殖品系改良 | 陳榮華、張湧泉、劉富光 | 2005 |
| 吳郭魚養殖藥物殘留及衛生安全監測模式之建立－I 藥物殘留篩檢 | 郭錦朱、楊佳諺、許月娥、陳紫媖、吳純衡、劉富光、陳冠如 | 2005 |