| 德翔臺北輪漏油污染對北海岸生態影響調查(II) | 張可揚、莊世昌、蕭聖代、葉信明 | 2019 |
| 澎湖低碳島離岸風機預定設置地點藻場造成技術研發與漁業資源調查 | 冼宜樂、楊子泰、呂逸林、陳岳川、蔡忠和、歐啟明、劉再豐、方鵬和、謝恆毅 | 2019 |
| 澎湖附近海域康氏馬加鰆年齡成長研究 | 翁進興、吳龍靜、賴繼昌、黃星翰、陳秋月、何珈欣、余淑楓、藍揚麒 | 2019 |
| 離岸風電潛力場域海洋生態、漁業資源與漁場利用調查(II) | 李純慧、陳均龍、莊世昌、蘇博堃、潘佳怡、陳人裕、曾秀茹、蔡孟昌、張可揚、李茂熒、劉康熙 | 2019 |
| 大型海藻藻床形成研究(Ⅱ) | 冼宜樂、鐘金水、謝恆毅、黃丁士 | 2018 |
| 以經驗模式進行2018 年臺灣北部海域鎖管資源趨勢預測 | 張可揚、戴靖萱、曾振德 | 2018 |
| 紅鋤齒鯛生殖特性調查 | 何珈欣、吳伊淑、傅奕翔、黃星翰、張麗美、陳秋月、黃建智、賴繼昌、吳龍靜 | 2018 |
| 鬼頭刀族群動態解析及生態習性之研究 | 江偉全、林憲忠、蔡富元、許紅虹、張景淳、周爰瑱、吳瑞賢 | 2018 |
| 彰化離岸牡蠣養殖試驗研究 | 藍揚麒、吳龍靜 | 2018 |
| 臺灣大目鮪標識放流研究 | 江偉全、林憲忠、蔡富元、許紅虹、張景淳 | 2018 |
| 臺灣北部地區蟹類漁業資源之調查評估(Ⅱ) | 陳均龍、莊世昌、金建邦、葉欣柔 | 2018 |
| 臺灣北部海域底棲漁業資源之調查評估－帶魚屬魚類 | 吳允暉、金建邦、劉康熙、陳人裕、羅方君、張海龍 | 2018 |
| 臺灣北部海域鎖管漁業資源之調查評估(Ⅲ) | 張可揚、陳人裕、陳玉姬、劉康熙 | 2018 |
| 臺灣西南海域帶魚屬魚類漁業資源之調查評估(Ⅳ) | 賴繼昌、吳龍靜、翁進興、楊清閔、何珈欣、余淑楓、吳依淑、黃建智、黃星翰、周慈慧、陳羿惠、陳秋月 | 2018 |
| 臺灣周邊海域漁場環境監測(IV) | 陳郁凱、潘佳怡、王友慈、曾秀茹、蘇博堃 | 2018 |
| 臺灣東部海域矛尾翻車魨生殖生物學研究 | 張景淳、許紅虹、江偉全、林憲忠、蔡富元 | 2018 |
| 臺灣沿海場域漁業活動及環境調查與放流物種資料建立－花東、高屏及澎湖離島(IV) | 吳瑞賢、江偉全、許紅虹、周爰瑱、何源興、吳龍靜、余淑楓、吳伊淑、陳律祺 | 2018 |
| 臺灣近海太平洋黑鮪漁況調查研究 | 金建邦、羅方君 | 2018 |
| 臺灣近海淺海狐鮫資源調查暨無危害風險評估研究 | 金建邦、羅方君 | 2018 |
| 德翔臺北輪漏油事件對北海岸生態影響調查 | 張可揚、莊世昌、陳威克、蕭聖代、陳郁凱、葉信明 | 2018 |