| 台灣西南海域正櫻蝦生態與漁業管理之研究 | 陳守仁、陳羿惠、林俊辰 | 2004 |
| 台灣西南海域拖網漁業資源之管理研究 | 吳春基、林俊辰、黃朝盛、翁進興、陳秋月、潘惠婉、張麗美、蔡家聖、呂梅籃、黃建智 | 2004 |
| 台灣周邊海域之新漁場造成研究 | 林俊辰、吳龍靜、翁進興、陳淑珍、謝勝雄、吳春基、陳秋月、潘惠婉、王敏昌、陳守仁 | 2004 |
| 台灣周邊海域漁場環境監測 | 劉燈城、吳世宏、吳龍靜、吳全橙、黃美瑩、康偉福、謝勝雄、翁進興、李政芳、陳淑珍、簡煌彬、陳秋月 | 2004 |
| 台灣東北海域浮游橈足類的季節性變動及其長期監測 | 李長縈 | 2004 |
| 台灣東部人工浮魚礁之規劃與設置 | 林俊辰、吳龍靜、翁進興、陳淑珍、謝勝雄、吳春基、陳秋月、潘惠婉、王敏昌、陳守仁 | 2004 |
| 台灣東部及西南部深海未利用資源之漁場調查及試驗研究 | 李定安、吳全橙、王敏昌、吳繼倫 | 2004 |
| 台灣海域烏魚資源調查與監測 | 黃朝盛、潘惠婉、黃建智、林俊辰 | 2004 |
| 多重衛星影像應用於東海海域颱風引發冷水渦之觀測與分析 | 曾振德、陳世欽 | 2004 |
| 鬼頭刀資源量之調查與研究 | 陳文義、何源興、江偉全、林富家、許紅虹 | 2004 |
| 漁場資訊遠程傳輸雛型系統之建立 | 曾振德、黃繼興、陳世欽 | 2004 |
| 澎湖縣海洋牧場環境監測調查 | 謝恆毅、冼宜樂、蔡萬生 | 2004 |
| 太平洋黑鮪之成熟與孕卵數 | 吳繼倫 | 2003 |
| 火誘網集魚燈燈光功率與漁獲關係之研究 | 秦韶生、康偉福 | 2003 |
| 台灣北部鯖鰺漁業資源之調查研究 | 廖學耕、李嘉林、黃士宗 | 2003 |
| 台灣西南海域正櫻蝦生態與漁業管理之研究 | 陳守仁、謝勝雄、黃朝盛、陳羿惠、林俊辰 | 2003 |
| 台灣西南海域拖網漁業之管理研究 | 林俊辰、吳春基、翁進興、陳秋月、潘惠婉、張麗美 | 2003 |
| 台灣周邊海域之新漁場造成研究 | 林俊辰、吳龍靜、翁進興、陳淑珍、謝勝雄、吳春基、陳 | 2003 |
| 台灣周邊海域浮游動物生物量與漁場環境之關係 | 劉燈城、吳世宏、吳龍靜、黃美瑩、謝勝雄、康偉福、陳淑珍、簡煌彬、陳秋月 | 2003 |
| 台灣東北部近海產之正櫻蝦資源評估研究 | 李定安、吳繼倫、吳全橙、王敏昌、林宏誠 | 2003 |