| 台灣沿岸海域魚卵及仔稚魚資源調查及評估 | 王友慈、康偉福、潘佳怡 | 2008 |
| 台灣近海鮪延繩釣漁業之鮪類漁獲特性分析 | 陳郁凱、張可揚、張中信、吳繼倫 | 2008 |
| 台灣產牡蠣遺傳多樣性研究 | 蕭聖代、梁宏彥 | 2008 |
| 澎湖海域生物多樣性基礎研究調查 | 謝恆毅、冼宜樂、陳仁偉、蔡萬生 | 2008 |
| 衛星影像及漂流浮標資料應用於黑潮暖流時空變動分析 | 曾振德、劉姵妤、陳世欽 | 2008 |
| 聲波遙測技術運用於台灣周邊海域浮游動物生物量變動之調查 | 藍揚麒、李忠憲、陳人平 | 2008 |
| 大型海藻海中造林之研究 | 謝恆毅、徐振豐、冼宜樂、陳仁偉、蔡萬生 | 2007 |
| 以耳石估算長腰鮪之年齡與成長 | 陳文義、江偉全、林富家、傅信欽 | 2007 |
| 台灣北部沿岸海域底延繩釣漁業資源調查 | 王友慈、林雅民 | 2007 |
| 台灣北部海域中小型拖網漁業資源調查研究 | 秦韶生、賴竹蘭、康偉福、莊世昌、陳玉姬 | 2007 |
| 台灣西南海域拖網漁業漁獲物之地理分布、漁況及生物特性調查研究 | 陳守仁、吳春基、葉信明、陳羿惠、黃建智、翁進興、張麗美、陳秋月、潘惠婉、邵琬絜、蔡家聖、李祐竑、吳龍靜 | 2007 |
| 台灣周邊海域漁場環境監測 | 藍揚麒、李長縈、陳彥民、簡煌彬、張玉真、楊珮芬、黃美瑩、陳秋月、王友慈、李定安、吳繼倫、劉燈城 | 2007 |
| 台灣周邊海域鯖鰺仔稚魚分布之調查研究 | 王友慈、李嘉林、吳全橙、巫金翰、康偉福、林雅民、曾振德 | 2007 |
| 台灣東部及西南部沿近海鮪旗魚標識放流之研究 | 翁進興、黃建智、洪銘昆、吳春基、吳龍靜、葉信明、李祐竑、賴繼昌、陳秋月、陳文義、江偉全、傅信欽、林富家 | 2007 |
| 台灣東部海域大陸斜坡未利用資源之調查及開發研究 | 吳全橙、吳繼倫、王敏昌、李定安 | 2007 |
| 台灣東部海域鬼頭刀資源之調查與評估 | 陳文義、江偉全、林富家、傅信欽、許紅虹 | 2007 |
| 台灣沿岸海域魚卵及仔稚魚資源調查及評估 | 王友慈、康偉福、潘佳怡、陳秋月 | 2007 |
| 台灣近海產龍蝦粒線體DNA核苷酸序列資料庫之建立 | 蕭聖代、梁宏彥 | 2007 |
| 我國遠洋鰹鮪圍網作業海域之衛星水溫及水色影像時空變動分析 | 曾振德、劉姵妤、陳世欽 | 2007 |
| 宜蘭縣櫻蝦漁場資源及水團特性 | 王敏昌、洪慶宏、李定安 | 2007 |