| 自動化系統在魚類染色體操作之應用研究 | 2008 | 農漁牧產業自動化領域 | 趙乃賢 |
| 潛水型RFID在國家水產種原庫種魚監測管理上之應用 | 2008 | 農業電子化領域 | 林志遠 |
| 強化水產數位內容及履歷規範之建立 | 2008 | 農業電子化領域 | 陳世欽 |
| 建構農業資源虛擬博覽體系－海馬多媒體 | 2008 | 農業電子化領域 | 陳世欽 |
| 飼料中植物性蛋白及胺基酸適量添加量之研究 | 2008 | 農業科技領域 | 楊順德 |
| 與澳洲進行蝦類育種相關學術交流 | 2008 | 農業科技領域 | 陳紫媖 |
| 藉由柵欄技術保持魚貨品質 | 2008 | 食品科技領域 | 王文政 |
| 海參加工副產物作為保健新素材之研發 | 2008 | 食品科技領域 | 黃培安 |
| 澎湖海域生物多樣性基礎研究調查 | 2007 | 加強生物多樣性及資源保育利用領域 | 謝恆毅 |
| 台灣重要經濟龍蝦類及口足目粒線體DNA核苷酸序列資料庫之建立 | 2007 | 加強生物多樣性及資源保育利用領域 | 李長縈 |