| 鯖魚頭開發貓類機能性飲品之研究 | 高翊峰、羅子鈞、蔡慧君 | 2019 |
| 大宗水產多元化產品之開發 | 葉念慈、陳文君、許洛瑋、歐秀美、蔡慧君 | 2018 |
| 水產加工剩餘物應用於餌料生物之培養 | 郭裔培、楊順德 | 2018 |
| 以乳酸菌發酵紅藻之產品開發 | 高淑雲、易琮凱、蔡慧君 | 2018 |
| 冷凍與生鮮水產品鑑識技術之研究 | 郭柏昇、葉駿達、蔡慧君 | 2018 |
| 利用漁業副產物開發伴侶動物皮膚保健之生物製劑 | 高翊峰、蔡慧君 | 2018 |
| 牡蠣殼利用於養殖之研究 | 林慧秋、廖紫嬿、許雅筑、陳東本 | 2018 |
| 牡蠣殼高值化之加工研究 | 葉念慈、許洛瑋、蔡慧君 | 2018 |
| 乳酸菌發酵紅藻和藻渣作為保健食品之研究 | 陳柏璇、杜明杰、蔡慧君 | 2018 |
| 建構漁產品重金屬安全背景值之監控(Ⅱ) | 郭科良、紀宏智、高堂穎、蔡慧君 | 2018 |
| 紅藻作為保骨素材之研發(Ⅱ) | 陳柏璇、杜明杰、蔡慧君 | 2018 |
| 庫達海馬酒精萃取物動物實驗功效評估 | 林慧秋、廖紫嬿、許雅筑 | 2018 |
| 褐藻作為改善肌肉流失之營養膳食補充品研發 | 高淑雲、易琮凱、蔡慧君 | 2018 |
| 水產再生資材之加工萃取與機能性素材開發研究 | 郭科良、紀宏智、蔡慧君 | 2017 |
| 水產資源再利用產業化發展策略 | 高淑雲、易琮凱、蔡慧君 | 2017 |
| 以分子料理技術開發富含水產功效性成分之銀髮族食品 | 高翊峰、蔡慧君 | 2017 |
| 以乳酸菌發酵紅藻之製程及發酵產物特性探討 | 高淑雲、易琮凱、蔡慧君 | 2017 |
| 建構漁產品污染物之風險分析及生產環境安全背景值之監控 | 郭科良、紀宏智、蔡慧君 | 2017 |
| 紅藻作為保骨素材之研發(I) | 蔡慧君、陳柏璇、杜明杰 | 2017 |
| 庫達海馬酒精萃取物對心肌細胞株(H9c2)及萊氏細胞(TM3)功能之影響 | 林慧秋、高雪卿、廖紫嬿、林金榮 | 2017 |